Klasifikuojama pagal pakrautų prekių rūšį

Yra sausų krovinių konteineriai, birių krovinių konteineriai, skystų krovinių konteineriai, šaldytuvų konteineriai, taip pat kai kurie specialios paskirties konteineriai, tokie kaip konteineriai automobiliams, konteineriai gyvuliams, gyvūnų odos konteineriai ir kt.
Bendras krovininis konteineris yra labiausiai paplitęs konteinerio tipas, daugiausia naudojamas generaliniams kroviniams vežti ir tinka įvairioms prekėms, kurioms nereikia reguliuoti temperatūros. Paprastai jis vadinamas bendrosios paskirties konteineriu.
Birių krovinių konteineris yra konteineris, naudojamas įvairiems biriems kroviniams, pavyzdžiui, milteliams ir granuliuotoms prekėms, pakrauti.
Skystų krovinių konteineris – tai konteineris, naudojamas skystiems kroviniams krauti.
Šaldymo konteineris – tai konteineris su šaldikliu ir ant vidinės sienelės išklotas žemo šilumos laidumo medžiagomis, naudojamas šaldytoms, izoliuotoms ir šviežioms prekėms krauti.
Automobilinis konteineris yra konteinerio tipas, skirtas specialiai automobiliams gabenti ir gali būti padalintas į du sluoksnius pakrovimui.
Gardo konteineris – tai konteineris, specialiai sukurtas gyviems gyvuliams vežti, su vėdinimo įrenginiais ir šėrimo bei mėšlo šalinimo įrenginiais.
Gyvūnų odos konteineris yra konteinerio tipas, specialiai sukurtas gabenti prekes, turinčias sulčių pratekėjimo savybių, pavyzdžiui, neapdorotą odą. Jis turi dvigubą dugną ir gali laikyti nutekėjusius skysčius.